电子发票代替纸质发票成为互联网时代的巨大红利，每年节约的各种成本有数千亿之多。然而《经济参考报》记者近日在采访中发现，由于整个财税无纸化链条没有完全打通，行业良性竞争的市场秩序也没有完全建立，作为一种本可利国利企、节约资源的新兴技术，电子发票的红利尚未惠及广大企业纳税人，大量小微企业甚至还有额外负担。
自2016年1月1日增值税电子发票全国推广以来，开票量较大的行业如电商、电信、快递、公用事业等行业的电子发票工作已经取得了一定进展。如京东电子发票截至2016年11月底已累计开具超6亿张。然而，单纯在发票环节实现电子化，显然达不到节约成本和节能环保的效果，因为在报销环节，纸质发票还是不可或缺的。
除了有“转嫁负担”之嫌，接收电子发票的企业还存在重复打印报销、多头报销或者被造假的风险。许多企业财务人员不愿意接受电子发票报销。纵使国家已经规定电子发票具有法律依据，属于合法凭证，但在利弊权衡之下，一些企业情愿走老路。
目前，很多企业均在第一时间执行“互联网 电子发票”，积极上线使用增值税电子发票。但由于目前推广的增值税电子发票系统是建立在专用设备（税控盘及税控专用服务器）基础上的，开户、购置、培训、使用较为烦琐，客户体验比较差。对于收票方来说，目前的电子发票不同的平台在系统维护管理水平、服务器稳定程度、界面友好度等方面参差不齐，体验也较差。且企业购置专用设备的投入也比较大。曾有机构测算过，增值税电子发票系统全面推广后，全国近7000万户中小微纳税人，仅完成税控盘首次购置的总成本就高达600多亿元。而且税控盘一般两三年就得更换一次，折算下来成本也在150亿元以上。此外，据税务系统内部估算，电子发票系统每年技术维护费高达160亿元左右。这里面，还不包含因与税控盘不匹配而不得不购置新电脑的成本。
一些科技企业在接受记者采访时表示，电子发票的推广从一开始就没有进行市场招标与选优，而是由主管部门直接安排两家企业来承接。目前推广的增值税发票系统升级版，是从20多年前的防伪税控系统发展而来，多年垄断经营“防伪税控系统”的某企业仍在继续垄断，从而阻止了其他社会机构和企业参与市场竞争的可能性。
业内人士认为，包括打通无纸化链条在内的财税体制改革要加快，行业内还必须破除垄断。中国电子商务研究中心一位专家在接受《经济参考报》记者采访时表示：“要最大限度减少政府对电子商务市场及各行业的行政干预。”
中投顾问金融行业研究员霍肖桦建议，电子发票若要得到较好推广，需要解决捆绑高价税控专用设备及让纳税人使用便利性最大化的问题。首先，可以在电子发票模式上多做探索和创新；其次，降低电子发票设备成本，或政府为企业购买税控机进行适当补贴；第三，健全电子发票的安全系统，增强电子发票安全系数。
许多业内人士提出，电子发票路径改革十分迫切，需要更多市场主体参与竞争和创新。应由国家出面建设统一的电子发票的管理平台，并出台电子发票行业标准与管理规范。在抛弃专用设备捆绑的基础上，进一步引入多元市场主体参与竞争，凭借严格的市场准入管控与自由竞争原则，来打造更加便捷高效、接口开放、数据安全有保障的社会化模式。