虽规模不断膨胀、挂牌企业近6000家，但流动性依旧是困扰新三板的一大难题。数据显示，去年12月份至今，新三板交易数据持续恶化，上周每日成交额仅约3亿元，挂牌企业日平均换手率约0.01%。
新三板官网行情信息显示，截至昨日收盘，三板做市指数报收于1250.46点，跌幅0.13%。当天新三板证券数量达到5831家，总股本3551.36亿股，全天成交股数9297.97万股，成交量5.54亿元，其中做市转让股成交额3.18亿元。
股转中心的交易数据显示，去年12月下旬，新三板每日成交总额在9亿元左右，但到了上周，新三板交投热度骤降，一周的5个交易日内总成交量分别为3.98亿元、5.1亿元、3.8亿元、4.8亿元以及4.2亿元，同期挂牌企业每日平均成交额由18万元降到6万元水平，挂牌企业每日平均换手率从0.03%降到0.01%水平。其中，周一、周三两个交易日成交在4亿元之下，无交易的做市企业占比超过四成，部分企业在实施做市起至今没有一笔交易。做市企业尚且如此，其他4400余家协议转让企业交易更为清冷。业内初步估算，目前新三板挂牌企业中，有超过50%的企业是无融资、无交易、无并购重组的“三无”企业。而在刚刚过去的1月份，金融市场大幅动荡对市场信心造成较大负面冲击，三板成指和三板做市指数分别下跌12.3%和13.6%，成交金额也较去年12月分别下降20%和30%。
对于交投数据每况愈下，市场人士认为，除了受到春节假期的影响，也显示新三板交易情况的确不容乐观。尽管改革步伐加快，但面临的问题依旧明显，这些问题主要是挂牌企业急速扩容，但交易并未以同样的速度增长，而挂牌企业单边快速扩容造成的市场均衡改变，或将抑制市场未来持续走强。